加速基因组学研究

英特尔与博德研究所携手开发适用于基因组学分析的强大且灵活的数据中心解决方案。

英特尔-Broad 基因组数据工程中心

英特尔-Broad 基因组数据工程中心的研究人员和软件工程师构建、优化并广泛分享新的工具和基础设施,这将帮助科学家整合和处理基因组数据。该项目目前正在优化基因组分析硬件和软件方面的最佳实践,以便可以合并和使用存储在私有云、公共云和混合云中的研究数据集。该中心的目标是让世界各地的研究人员能够通过访问以往可能无法获得的数据更快地获得可靠的结果。

英特尔与 Broad 携手提供基因组学堆栈

英特尔与 Broad 研究所携手推出了一款全新的集成式硬件和软件解决方案 (英文),用于提高 Broad 倍受欢迎的基因组分析工具套件的运行速度,规模前所未有,而且更便于开源 (英文)部署。请查看下方我们的解决方案合作伙伴。

共同愿景是促进科学发现

以帮助世界各地的研究人员更快获得最终能够改善人类健康的见解为使命。

Broad 研究所首席数据官 Anthony Philippakis (医学哲学博士)介绍了英特尔与 Broad 的合作进展。

了解我们的合作 (英文) ›

我们的基因组分析愿景

健康与生命科学思想领导者的最新动态

Broad-Intel Genomics Stack* (BIGstack*)

了解 Broad-Intel Genomics Stack* (BIGstack*) 如何帮助加速基因组学研究和全基因组测序。

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借助 OpenCL™ 和 FPGA 加速基因组学研究

了解英特尔与 Broad 研究所如何使用运行 GATK HaplotypeCaller 算法的 OpenCL™ 和 FPGA 帮助加速基因组学研究。

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借助英特尔® Select 解决方案实现计算基因组学和分析

了解英特尔与博德研究所如何通过硬件和软件解决方案,携手推动计算基因组学发展。

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GKL 压缩

使用 GKL 压缩优化后,性能提升高达 2.8 倍。

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GATK* 基础设施

为 GATK* 基因组学分析实施硬件和软件最佳实践。

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FPGA 加速

借助 FPGA 的能力,单体型识别 / PairHMM 功能的性能显著提升。

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全基因组分析

适用于加速全基因变异分析性能的英特尔集群架构。

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以少量柱状阵列的形式存储基因组数据

GenomicsDB 是一种面向基因组变异和可能性的存储技术。

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了解最新的健康与生命科学博客讨论


开发人员资源

访问适用于优化基因组分析的开源框架,以及适用于实施、基准性能测试和自定义的代码和参考架构。

基因组分析工具套件*

行业领先的分析解决方案。现与关键支持组件捆绑在一起,更便于实施。

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获取 GATK* (英文)

Cromwell

博德的工作流描述语言 (WDL) - 基于执行管理引擎。灵活且是开源的,适用于本地或云端运行。

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获取 Cromwell (英文)

基因组学内核库*

适用于支持 64 位 Linux* 和 Mac OSX* 的英特尔® 架构的优化计算内核。包括适用于 PairHMM、igzip 压缩和 otc_zlib 压缩的内核。

详细了解并获取 GKL (英文)

GenomicsDB

适用于基因组变异数据管理的高度优化的专用稀疏数据阵列。

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获取 GenomcsDB (英文)

Lustre*

适用于 HPC 大数据工作负载的并行文件系统。含带适用于 Lustre* 软件的英特尔® 解决方案。

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获取 Lustre

HTCondor

适用于 HPC 的工作负载管理、作业排队、调度、优先级排序、资源监视和资源管理。

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获取 HTCondor (英文)

英特尔® Omni-Path 架构

高性能数据中心通信架构,具有低延迟、低功耗和高吞吐量的特点。

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获取英特尔® Omni-Path 软件

英特尔® 可扩展系统框架(英特尔® SSF)

英特尔® 可扩展系统框架(英特尔® SSF)结合了英特尔的计算、内存和存储、架构及软件技术,为下一波 HPC 提供支持。

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Broad-Intel Genomics Stack 是一款运行 GATK* 的集成式解决方案,充分利用了英特尔最新的计算、架构、内存和存储技术。

英特尔产品

英特尔® 至强® 处理器 E5 家族

在现有服务器级基础设施上实现高吞吐量评分。

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英特尔® 至强融核™ 处理器家族

实现在稳健、可扩展的基础设施上缩短培训深度神经网络的时间。

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