闪存技术在高性能计算中加快科学发现的步伐

英特尔® 至强™ 处理器 E5 系列和英特尔® 固态盘助力计算化学家和生物学家提高研究效率。

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闪存技术在高性能计算中加快探究发现的步伐

英特尔® 至强® 处理器 E5 系列和英特尔® 固态硬盘助力计算化学家和生物学家提高研究效率。

简介
SDSC 是数据密集型计算领域的领导者,一直为包括行业和学术机构在内的国家研究团体提供资源、服务和专业知识。SDSC 的使命是通过为这些团体提供诸如高性能硬件技术、综合 软件技术和深度跨学科专业知识,扩展科学研究的范围。2012 年,SDSC 部署了首个大规模使用闪存的高性能计算群集 — Gordon 。Gordon 由 Appro International 负责构建,后者曾为全球各地的学校、政府研究实验室和公司部署高性能计算。

I/O 难题
当今,很多科学和数据密集型应用程序都具有数据访问模式随机或超小型事务操作频繁的特点。传统 HPC 体系结构提供了构建于旋转磁盘技术之上的大规模平行文件系统(如 Lustre),却并不适用于这类 I/O 需求。相关的文件系统和机械延迟都太高而无法在应用程序在平行文件系统和 CPU 间移动数据时提供 I/O 事务支持。

解决方案
Gordon 通过在平行文件系统和计算节点间部署 300 TB 英特尔® 710 系列固态硬盘(目前切换到英特尔® DC S3700 系列固态硬盘),进而在计算层级间插入了一个全新的层。六十四个英特尔 Westmere I/O 节点中的每个节点都包含 16 个英特尔 710 系列固态硬盘,这些节点为用户提供了资源,可用于数据库和分析应用程序的快速暂存空间或永久性存储。

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