面向 HPC 的第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器在生命科学领域大展拳脚

20 多年来,英特尔与全球软件社区始终保持紧密合作,针对英特尔® 至强® 可扩展处理器优化了重要的生命科学代码。

  • 将英特尔® oneAPI 开放而统一的编程模型与基于类似且经验证的 CPU 工具打造而成的英特尔® oneAPI HPC 工具套件结合使用,开发人员可以更加轻松地针对基于英特尔® 技术的 HPC 系统优化生物信息应用。

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作者

借力英特尔,赋能科学发现

从基因组学到低温电子显微技术,再到分子建模,高性能计算 (HPC) 可帮助科学家利用更大的数据集和人工智能驱动型方法,加快科学发现的前进步伐。若传统仿真应用和融入了深度学习的工作负载都能提速,研究人员就能在满足关键时间节点的同时扩大研究范围。

第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器为一系列学科的生命科学和生物信息应用提供强大支持,帮助科研团队更快获得重大发现。


性能测试结果

诸多领域的生命科学应用在第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器上的运行表现均胜过前几代产品1。很多应用都利用英特尔® AVX-512 技术来实现处理加速,并且与 AVX2 技术相比获得了显著提升。内核数、内存带宽以及每时钟周期指令执行量的增加,也使一些工作负载的性能得到提升。

此外,使用英特尔® oneAPI 跨架构工具套件的软件开发人员还可以更轻松地面向英特尔® 至强® 可扩展处理器优化他们的应用,让原有性能获得提升。例如,在同一英特尔® 至强® 可扩展处理器上运行时,经过我们优化的 NAMD 版本的性能表现要比未优化版本高 54%2

 

•     NAMD 性能提升高达 57%(与上一代产品相比)1
•     GROMACS 性能提升高达 64%(与上一代产品相比)1
•     LAMMPS 性能提升高达 60%(与上一代产品相比)1
•     RELION 性能提升高达 61%(与上一代产品相比)1

 

价值与优势

性能表现得到提升的应用为各类生命科学企业和机构带来多重优势:
算力研究人员可更快获得研究结果并能扩展数据驱动型研究的范围
HPC 解决方案架构师可提升系统价值和业务影响力,并能腾出花在系统上的时间,用于处理新项目
开发人员可充分实现硬件价值,安心地开发和部署软件
业务负责人可缩短新治疗方案的上市时间,同时为实现更好、更快的诊断以及更好的治疗效果提供支持


重要特性

看第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器与上一代产品的比较情况:
• 每路多达 40 个内核
• 8 条 DDR4 3,200 MT/s 内存通道
• 通过配置,每个处理器可支持高达 6 TB 的系统内存
• 支持英特尔® 傲腾™ 持久内存 200 系列
• 集成 HPC 和 AI 加速技术:英特尔® AVX-512 技术和英特尔® 深度学习加速技术
• 采用英特尔新的 CPU 微架构,性能更优
• 支持 PCIe Gen4,每路 64 条通道,16 GT/s 加速
• 集成英特尔® Speed Select 技术,实现对 CPU 性能的细粒度控制


面向 HPC 的第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器的相关资源

产品简介:
面向 HPC 的第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器
产品信息图:
面向 HPC 的第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器
性能信息图:
基于第三代英特尔® 至强® 可扩展处理器的 HPC 应用


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面向生命科学的英特尔® 精选解决方案

英特尔与 Broad Institute 合作,共同开发了面向基因组分析的英特尔® 至强® 精选解决方案。
该套解决方案由一系列已优化的软件及参考架构组成,可实现一站式配置、安装和部署,从而运行符合 GATK 管道、Cromwell 及 GenomicsDB 要求的基因组分析。

更多信息,请阅读我们的
面向基因组分析的英特尔® 精选解决方案